Į šią idėją skeptiškai žvelgia nemaža dalis mokslininkų ir žvejų mėgėjų. Jie įsitikinę, kad ežerų valymas cheminiu būdu gali kelti grėsmę ežerų ekosistemomis. Pasigirsta netgi būgštavimų, ar taip išvalytuose ežeruose bus saugu maudytis.
Viešojoje erdvėje pasirodžius straipsniams apie tai, kad ežerų valymas cheminiu būdu yra potencialiai žalingas aplinkai, Aplinkos ministerijos tinklalapyje pasirodė atsakomasis pranešimas. Jame teigiama, jog tokia ežerų valymo praktika sėkmingai taikoma užsienyje. Be to, pranešimo autoriai teigia išklausę užsienio ekspertų komentarus, kurių metu pateikta daugiau nei 100 pavyzdžių, įrodančio tokio ežerų valymo naudą.
Kol kas tikslesnė informacija apie tai, kada šis ežerų valymo būdas bus pradėtas taikyti Lietuvoje, nėra. Aplinkos ministerija planuoja atlikti bandomąjį projektą nedideliame uždublėjusiame ežerėlyje (jo pavadinimas neskelbiamas). Projektą iki 2020 m. įgyvendins Aplinkos apsaugos agentūra iš ES Sanglaudos fondo lėšų.
